ในการพัฒนาซอฟต์แวร์นั้น คือการเพิ่มความสามารถให้กับระบบปฏิบัติการในการพัฒนาใช้เครื่องมือในการพัฒนาโค๊ด คือ Visual C++ใช้เขียนและจัดการโค๊ด ทำงานด้วย.NET Compact Framework หรือ โค๊ด Server-side นั้นสามารถที่จะเปลี่ยนแปลง โดยใช้ Internet explorer บนอุปกรณ์ของผู้ใช้เอง

โมเบิลวินโดวส์ถูกพัฒนาใน Visual Studio มันสามารถสร้างแบบจำลองภาพ เพื่อให้ผู้พัฒนาระบบได้ทำการทดลองทดสอบและค้นหาบัก และช่วยกันเขียนแอปพลิเคชันขึ้นมา

ก่อนที่จะนำเข้า Windows Mobile 2003 ซอฟต์แวร์ถูกพัฒนาโดยใช้ Microsoft’s Embedded Visual Tools